L'alchimista d'acciaio: I fratelli Elric sono incaricati di catturare Isaac, ex alchimista di Stato, che intende uccidere King Bradley.
Il giorno dell'inizio: Uno sguardo al passato rivela il dolore e la disperazione che spinse i fratelli Elric a infrangere un grande tabù dell'alchimia: la trasmutazione umana.
La città dell'eresia: Scienza e fede si scontrano quando i fratelli Elric affrontano Cornello, che usa una finta pietra filosofale per manipolare il suo gruppo.
Il tormento dell'alchimista: I fratelli Elric incontrano Shou Tucker, che può insegnare molto a Ed e Al sull'alchimia e sull'orrenda crudeltà che spesso l'accompagna.
Pioggia di dolore: Edward e Alphonse vengono aggrediti da Scar, un misterioso killer molto potente e ricercato per una serie di omicidi crudeli.
La strada della speranza: I fratelli Elric conoscono il dottor Marcoh, un alchimista in fuga dal passato. Marcoh ha informazioni essenziali per avere la pietra filosofale.
La verità nascosta: I fratelli Elric scoprono il terribile ingrediente necessario per la pietra filosofale ed entrano in un laboratorio segreto per saperne di più.
Il laboratorio 5: Ed e Al affrontano le guardie del quinto laboratorio. Nella confusione generale, la verità sulla pietra filosofale finisce sepolta fra le macerie.
Ricordi artificiali: Quando Al si ribella all'idea che la sua vita sia stata creata dal fratello, solo Winry riesce a convincerlo che sta sbagliando.
Destinazioni separate: Quando la cospirazione per la pietra filosofale arriva agli alti ranghi militari, uno degli alleati più fidati di Mustang viene ucciso.
Il miracolo di Rush Valley: L'alchimia deve ancora svelare come si crea la vita; così gli Elric si scoprono impotenti quando una loro nuova amica va in travaglio.
Uno è tutto, tutto è uno: I fratelli Elric fanno visita a Izumi, la maestra di alchimia, e ricordano la difficoltà di comprendere il principio dello scambio equivalente.
Le bestie di Dublith: Quando Al viene rapito dalle chimere e il tentativo di liberarlo di Ed fallisce, Izumi dimostra ancora una volta di pensare al bene dei fratelli.
Coloro che si appostano sottoterra: King Bradley dimostra tutta la sua brutalità nella battaglia contro Greed. Ma l'uomo che distrugge lo Scudo perfetto è più forte anche del Comandante.
L'emissario dell'est: Gli Elric si azzuffano con Ling Yao e i suoi assistenti Lan Fan e Fu alla ricerca della pietra filosofale.
Sulle tracce di un compagno d'armi: L'invidia è ancora ben evidente tra gli alchimisti di stato, e un altro homunculus è sul punto di infiltrarsi tra loro.
Fiamme spietate: Anche i più fedeli all'Alchimista di fuoco sono scossi da quanto fatto da Roy Mustang contro l'assassino di Maes Hughes.
Il palmo della mano arrogante di un piccolo essere umano: Il viaggio di Ed in una terra lontana riserva dettagli sorprendenti sull'incontro tra Mustang e Maria Ross. Edward, intanto, scopre un segreto sui genitori di Winry.
La morte dell'immortale: Mustang, Alphonse, Havoc e Hawkeye si dividono per trovare un laboratorio militare. Se Lust ha la meglio, nessuno di loro sopravviverà.
Il padre di fronte alla tomba: Hohenheim se ne va dando un avvertimento a Pinako; tra i ricordi della sua infanzia, Ed ritrova la speranza di poter riportare Al nel suo corpo.
Anticipo del buffone: Ed e Al escogitano un piano pericoloso per attirare gli homunculus fuori dal loro nascondiglio. Prima fase: rischiare la morte per mano di Scar.
Quelle figure in lontananza: Winry scopre il ruolo avuto da Scar nella morte dei genitori e si ritrova di colpo con i suoi stessi istinti omicidi.
La ragazza sul campo di battaglia: La collaborazione tra la cricca di Mustang e la banda di Ling Yao porta alla cattura di un homunculus, ma attira anche l'attenzione di una spia...
All'interno della pancia: I poteri alterati di Gluttony schiacciano gli Elric. Intanto, Mustang dà credito ai suoi sospetti su Bradley e si ritrova nei guai.
Il portale oscuro: Ed e Ling affrontano un nemico tremendo nell’infernale stomaco di Gluttony. Al Comando centrale, Mustang assiste alla divisione dei suoi soldati da parte di Bradley.
Riunione: Verità preoccupanti vengono a galla quando Al trova colui che viene chiamato il Padre. Ed ancora una volta infrange il più grande tabù dell'alchimia.
La festa della soglia: Hohenheim riflette sulla follia dell'uomo, richiamando immagini del passato: le sofferenze legate alla famiglia, l'alchimia e le radici della guerra.
Padre: Gli Elric affrontano Padre, ma non possono fare nulla quando lui si mette a creare homunculus con un'alchimia che sembrava impossibile.
La disperata lotta di uno stupido: Se i fratelli fanno una mossa sbagliata, Bradley si rifarà sulle persone a loro più care e la pietra filosofale potrebbe non servire.
La guerra di sterminio ad Ishval: Dai racconti di Hawkeye, Edward apprende degli orrori della guerra di sterminio e dei giovani soldati incaricati del genocidio.
La promessa da 520 cents: Anche se i suoi sottoposti sono fuggiti, Mustang trova nuovi alleati, ma lo stesso fa il nemico liberando un killer.
Il figlio del Comandante supremo: Mustang riesce a ispirare nuove ambizioni in un vecchio amico, un alleato con soldati. Intanto, Ed e Al incontrano il loro fan più sfegatato.
La parete nord di Briggs: Le terre a nord diventano un campo di battaglia quando Kimblee si avvicina a Scar. Ed e Al lottano contro gli elementi per raggiungere Fort Briggs.
La regina di ghiaccio: I soldati della Fortezza di Briggs vigilano sulla presenza di spie. Il complesso sembra impenetrabile, ma un violento intruso dimostra il contrario.
La forma di questo Stato: Ed scopre la verità sconvolgente sul piano che ha già mietuto innumerevoli vittime. E tutto fa pensare che presto anche alla fortezza di Briggs scorrerà il sangue.
Ritratto di famiglia: Mentre Raven prova a corrompere Armstrong, Ed e Al aspettano in cella. Tempo prima, anche il padre ha sperimentato la prigionia e per sfuggire al dolore, se n’è andato.
Il primo homunculus: Mentre Hawkeye resta impietrita davanti al primo homunculus, Kimblee fa una proposta a Edward, ma prima deve accettare di diventare un assassino di massa.
Scontro a Baschool: Quando Scar è messo alle strette da due chimere, gli Elric si trasformano nei suoi improbabili alleati. Più tardi, Winry cerca di affrontarlo con risultati disastrosi.
Un sogno ad occhi aperti: Winry viene rapita da Scar e non c'è ancora un piano per salvarla. Una fortissima tormenta s'avvicina, ma solo Alphonse Elric riesce ad affrontarla.
Il piccolo uomo nell'ampolla: Molto tempo fa, il sangue di un povero schiavo è stato usato in un esperimento per dar vita a una strana creatura informe.
Inferno: Uniti non solo da un legame di sangue, i fratelli Elric hanno sempre condiviso gioie e dolori, ma il rapporto mistico delle anime potrebbe essere loro fatale.
I segni del contrattacco: Gli sforzi di May e Marcoh per decifrare la ricerca del fratello di Scar iniziano a dare frutti, ma potrebbe essere troppo tardi per impedire la catastrofe.
Il morso della formica: Nel nord i soldati di Fort Briggs affrontano un esercito invasore e Marcoh conduce un attacco contro il mostruoso Envy.
Nel pieno delle forze: Van Hohenheim e Alphonse hanno l'opportunità di riavvicinarsi e riallacciare il loro legame, ispirando il padre a condividere i suoi segreti con i figli.
Il giorno della promessa: I segnali sono dappertutto: il Giorno della promessa sta arrivando.
L'ombra degli inseguitori: I piani di coloro che si apprestavano a reclamare la terra vengono rivelati e l'assassinio di un potente leader crea il caos.
Il messaggero dell'oscurità: Dall'armatura di Al echeggia una voce sinistra ed Ed e Greed si ritrovano sotto attacco.
Giuramento nei sotterranei: Dopo aver esplorato le intricate origini dell'albero genealogico dei Bradley, Mustang riunisce i suoi soldati più fedeli.
Sentimenti di famiglia: Con l'aiuto di suo padre, Al riesce a fare l'impossibile per combattere il mostruoso Pride.
Agitazione a Central City: Mustang guida una forza d'assalto composta da coraggiose truppe nordiche e volti del passato contro la difesa del Comando centrale.
L'esercito immortale: La squadra di Ed deve affrontare un'orda di avidi manichini alimentati da anime umane.
La forza di tutti: Grazie a una pietra filosofale in suo possesso, Alphonse affronta senza paura Pride e Kimblee.
Le fiamme della vendetta: Le voci su un presunto colpo di stato aiutano i ribelli, mentre May attira Envy in una trappola che porta a uno scontro con Mustang.
Al di là del fuoco impetuoso: Edward scopre che Envy vuole portare scompiglio nel gruppo. Le cose cominciano a cambiare durante la battaglia tra i fratelli Armstrong e Sloth.
Come si comporta un adulto: Finito uno scontro, ne comincia un altro. Hohenheim e il Padre si affrontano per il possesso della pietra filosofale.
Il ritorno del Comandante supremo: Padre elabora la propria fuga mentre Bradley affronta potenti avversari durante l'attacco al quartier generale centrale.
Eterno riposo: Mentre Bradley e Fu si affrontano in uno scontro mortale, il gruppo di Edward incontra il creatore di Bradley, che li porta ad affrontare una nuova sfida.
Sacrifici: Ling sfrutta la potenza di Greed per distruggere il nemico davanti al cancello. Intanto, Edward trova Van Hohenheim e cade in una trappola.
Perdere la luce: Mentre Edward, Alphonse, Van Hohenheim, Izumi e Mustang aspettano che si compia il loro destino nel nascondiglio del Padre, la situazione precipita.
L'occhio del cielo, la porta della terra: Come programmato, il Padre assorbe tutte le anime di Amestris e si appresta a inglobare la Verità attraverso un portale apertosi nel cielo.
Colui che vorrebbe inghiottire il Fondatore: Un'eclissi dà speranza alle anime di Amestris, mentre Hohenheim rivela un piano preparato molto tempo prima. Edward affronta Pride per l'ultima volta.
Un feroce contrattacco: Edward, Armstrong e Izumi trovano il modo d'indebolire gli intensi attacchi del Padre, mentre Alphonse si sacrifica per aiutare il fratello.
Dall'altra parte della porta: Dopo un chiarimento finale con il Padre, Edward ripaga il sacrificio di Alphonse con il proprio. Van Hohenheim trova finalmente la pace.
La fine del viaggio: I fratelli Elric tornano a Resembool pronti a una nuova vita. Edward e Winry, intanto, confessano ciò che provano.
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