Episodio 1: Il dottor John Watson riprende la sua carriera medica come capo di una clinica dedicata al trattamento di malattie rare sei mesi dopo la morte del suo amico e socio, Sherlock Holmes, per mano di Moriarty.
Episodio 2: Watson e i colleghi indagano sul caso perplessore di un familiare con un proiettile depositato nella sua testa che insiste di essere un soldato scozzese e sembra nascondere qualcosa di nefasto.
Episodio 3: Watson e i colleghi trattano un comico che collassa in una notte di nebbia aperta, ma nel caso in cui il suo passato si riveli molto più complesso di quanto inizialmente si credesse.
Episodio 4: Quando Sasha scopre un legame tra il suo attuale paziente, che ha tumori avanzati e lesioni distintive sulla sua lingua che indicano la sindrome di Cowden, e un cadavere che ha dissezionato durante la scuola medica, la squadra traccia il caso al paese Amish.
Episodio 5: Watson corre un grave rischio etico quando decide di trattare un malato con un intervento chirurgico non ortodosso, e la squadra affronta il proprio dilemma quando deve decidere se guardare dall'altra parte o aiutare la giovane donna.
Episodio 6: Stephens ha il coraggio di chiedere a Watson di aiutarlo quando la sua ragazza crolla improvvisamente durante una videochiamata. Non sa niente della sua vita reale, quindi la squadra deve agire rapidamente per localizzarla prima che sia troppo tardi.
Episodio 7: Mentre Watson e la squadra aiutano una donna la cui memoria si sistema ogni tre minuti, Watson lotta con allucinazioni uditive e si chiede se qualcuno stia dietro al suo attuale declino. Moriarty traccia la sua prossima mossa.
Episodio 8: Watson incontra un brillante con artista e un vecchio amico di Sherlock Holmes, Irene Adler, quando suo figlio Angus è ammesso a UHOP per paralisi temporanea. I ragazzi aiutano Watson dopo che si è affezionato a Angus e perseguono vari risultati per trovare una cura della sua malattia.
Episodio 9: Le bugie di Ingrid tornano a perseguitarla quando la sorella Gigi deve essere trattata dalla squadra dopo aver sviluppato effetti collaterali sulle cure segrete. Ingrid l'ha fatta passare. Inoltre, Watson e Mary sono legati a una tragedia.
Episodio 10: Watson è coinvolto in un caso di detective quando non è sicuro che il paziente che sta trattando per uno dei problemi più rari del mondo, la sindrome di Alien Hand, sia colpevole di spingere suo fratello davanti a un autobus alla sua morte.
Episodio 11: Watson affronta un evento traumatico dei giorni dell'esercito che pesa ancora pesantemente su di lui quando la moglie del suo amico veterano dell'esercito cerca aiuto quando suo marito sembra avere una rottura psicotica. Nel frattempo, a Shinwell viene chiesto un ultimo favore da Moriarty.
Episodio 12: Quando una parte della squadra si ammala dopo essere diventata un bersaglio di un complotto sinistro, diventa una situazione a tutti gli effetti per salvarli prima che sia troppo tardi. Nel frattempo, Watson annuncia un nuovo progetto ambizioso su cui sta lavorando.
Episodio 13: Watson e la squadra si trovano di fronte a una scelta impossibile quando due vite rimangono in equilibrio, ma hanno solo un flaconcino di antidoto disponibile. Nel frattempo, Shinwell corre per aiutare la squadra e Watson si dirige verso Moriarty.
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